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HIV-1Rev蛋白和人DDX3解旋酶對HCVRNA復制產生的作用研究論文

實用文 時間:2021-08-31 手機版

  丙型肝炎病毒(hepatitisCvirus,HCV)和人類免疫缺陷病毒(humanimmunodeficiencyvirus,HIV)的傳播途徑十分相似,約30%的HIV陽性患者合并HCV感染。在中國的靜脈藥癮的HIV感染者中,HCV陽性率可高達90%。HCV患者合并感染HIV將加速丙型肝炎病程進展,同時降低抗HCV療效。近年較多研究表明,對合并感染患者針對HIV進行嚴格的高效抗逆轉錄病毒治療(highlyactiveantiretroviraltherapy,HAART)不能有效地改善這些情況,同時HCV病程加速也與CD4+T淋巴細胞數量下降無明顯關聯。我們前期的研究也證實,HIV合并感染可能導致患者體內HCV準種分布特征改變,但HCV載量及準種復雜度與CD4+T淋巴細胞數量無關。以上證據提示HIV對HCV的影響可能存在其他途徑。有研究證實HCV、HIV可以共感染同一肝細胞,進而可能導致兩種病毒在同一細胞內發生相互作用。HCV、HIV均為RNA病毒,而DDX3在人體細胞內與RNA的復制過程關系密切,已有研究證實DDX3可與HCVCore蛋白結合促進HCV的復制。同時發現HIV-1Rev蛋白可與DDX3結合在核膜上形成復合體從而導致細胞質內DDX3的水平下降,也有研究表明,Rev蛋白可以與HCV5'-UTR作用直接促進HCV的復制。但是尚未有研究證實Rev蛋白可以通過間接作用影響HCV的復制,或通過影響其他細胞代謝途徑影響HCV的復制,也沒有研究證實Rev蛋白和DDX3可以共同作用并對HCV的復制產生影響。

HIV-1Rev蛋白和人DDX3解旋酶對HCVRNA復制產生的作用研究論文

  本實驗通過分別構建HCVRNA復制細胞模型及表達DDX3、Rev+DDX3的HCVRNA復制細胞模型,研究Rev蛋白和DDX3對HCVRNA復制的影響。旨在為進一步深入研究Rev蛋白和DDX3是否通過共同作用,從而影響HCVRNA復制。

  1材料與方法

  1.1材料

  Huh7肝癌細胞系和HCV復制模型pCDNA3.1-JFH1均為本實驗室保存,Huh7細胞系生長于含10%滅活小牛血清、2mmol/L谷氨酰胺、氨芐青霉素(100U/mL)、鏈霉素(100U/mL)和DMEM培養基中,37℃、5%CO2條件下培養。實驗中主要材料包括:真核過表達質粒pCDNA3.1(鼎國生物技術有限公司,北京),各種工具酶、核酸標準分子量Marker以及蛋白質預染Marker(天根生化有限公司,北京),去內毒素質粒大量提取試劑盒(Qiagen公司,德國),質粒轉染轉染試劑Lipofectamine2000(Invitrogen公司,美國),鼠抗Flag單克隆抗體(Sigma公司,美國)、兔抗人GAPDH單克隆抗體、小鼠抗人DDX3單克隆抗體、小鼠抗HIVRev單克隆抗體(Abcam公司,美國),HRP標記的羊抗兔IgG二抗,HRP標記的羊抗小鼠IgG二抗(福州邁新公司中國),qPCR引物由Invitrogen公司合成。

  1.2方法

  1.2.1含Rev、DDX3基因重組真核表達載體的構建查詢NCBI獲得Rev蛋白和DDX3的基因表達序列,并分別在其基因的5'端引入限制性酶切位點EcoRⅠ和增強表達的Kozak序列,3'端引入限制酶切位點XbaⅠ和便于Rev、DDX3表達檢測的Flag標簽蛋白(DYKDDDDK)編碼序列,以及便于觀察轉染效率的mCherry和YFP序列。以上相關基因序列由深圳華大生物科技有限公司協助合成。進一步分別將各自基因序列插入真核過表達載體pCDNA3.1中命名為pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pcDNA3.1-DDX3-YFP-Flag。從GenBank中查詢目的基因以及上下游的序列,用VectorNTI軟件進行PCR引物設計。載體pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry正向引物(5'-AGTCCAGTGTGGTGGAATTCGCCACCATGGAGCCAGTAGATCCTAG-3')(含同源重組序列、EcoRⅠ酶切位點、Kozak序列,并含有目的基因5'端配對序列),(5'-TAGTCCATGGTGGCGAATTCTTCTTTAGTTCCTGACTCCAATAC-3')(含同源重組序列、EcoRⅠ酶切位點,并含有目的基因3'端配對序列)。載體pcDNA3.1-DDX3-YFP-Flag正向引物5'-ACGATGACGATAAGCTCGAGGCCACCATGAGTCATGTGGCAGTGG-3'(含同源重組序列、XhoⅠ酶切位點、Kozak序列,并含有目的基因5'端配對序列),反向引物5'-GTTTAAACGGGCCCTCTAGATCAGTTACCCCACCAGTCAAC-3'(含同源重組序列、XbaⅠ酶切位點,并含有目的基因3'端配對序列)。

  1.2.2重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pcDNA3.1-DDX3-YFP-Flag質粒的鑒定用構建好的重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pcDNA3.1-DDX3-YFPFlag質粒分別轉化入大腸桿菌DH5α中,均勻涂布接種于含有氨芐青霉素的瓊脂糖平板上,次日挑取陽性單克隆菌落搖菌擴增后,抽提質粒進行PCR擴增并進行瓊脂糖凝膠電泳,對擴增產物進行回收,并進行核酸測序。

  1.2.3重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag及pCDNA3.1-JFH1質粒的轉染采用Lipofectamine2000轉染試劑,實驗步驟按照使用說明書進行操作。將重組pCDNA3.1-Rev-FlagmCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag質粒分別瞬時轉染入Huh7細胞中,通過熒光顯微鏡觀察轉染效率。pCDNA3.1-JFH1瞬時轉染入Huh7細胞中,qPCR檢測HCV的復制情況。

  1.2.4Westernblot鑒定Rev、DDX3基因在Huh7細胞中的表達分別轉染48h后,提取細胞總蛋白,進行SDS-PAGE電泳。在4℃下、300mA恒流條件下電轉120min,用封閉液(含5%脫脂牛奶的TBST)室溫封閉PVDF膜1h,TBST洗膜3次,每次10min,一抗加入1∶5000比例稀釋的anti-Rev單克隆抗體4℃孵育過夜,TBST洗膜3次,每次10min,二抗加入1∶5000比例稀釋的辣根過氧化物酶標記的羊抗兔IgG抗體室溫孵育2h,TBST洗膜3次,每次10min。化學發光試劑檢測,以GAPDH為內參。

  1.2.5qPCR檢測細胞內Rev、DDX3對HCV復制的影響用Lipofectamine2000轉染試劑,實驗按照使用說明書進行操作。將pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag和pCDNA3.1-JFH1瞬時共轉染入Huh7細胞中,qPCR檢測HCV復制情況。將pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag及pCDNA3.1-JFH1瞬時共轉染入Huh7細胞中,qPCR檢測HCV復制情況。查詢NCBI中HCV基因組序列,以5'非翻譯區為模板設計引物,引物序列為HCV-F:5'-CCCTGTGAGGAACTACTGTCTT-3';HCV-R:5'-TGAGCGGGTTTATCCAAG-3'。引物序列由美國Invitrogen公司合成。擴增條件為95℃預變性1min,95℃變性10s,58℃退火擴增30s,循環40次,最后添加65~95℃溶解曲線。標準曲線:取1μgPCDNA3.1-JFH1按10倍梯度稀釋5個梯度后按上述體系進行Real-timePCR檢測,最終將每個梯度的Ct值帶入對應終濃度計算函數,最終以該函數計算每個樣品中對應的HCV復制水平。

  1.3統計學處理

  采用SPSS17.0進行統計,實驗組與對照組采用兩獨立樣本t檢驗檢測均值是否有顯著性差異。

  2結果

  2.1重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag真核表達載體的鑒定含pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherryg質粒的菌液經擴增培養后提取純化質粒,進行PCR鑒定,產物經5%瓊脂糖凝膠電泳,分別出現1條特異性條帶,均位于400bp附近。核酸序列測定結果顯示,克隆的外源基因全長394bp。含pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag質粒的菌液經擴增培養后提取純化質粒,進行PCR鑒定,產物經5%瓊脂糖凝膠電泳,分別出現2條特異性條帶,分別位于2000bp附近,選擇與預期產物大小接近的條帶進行膠回收并測序。核酸序列測定結果顯示,克隆的外源基因全長2035bp。通過對克隆的外源基因序列測序并和GenBank中Rev和DDX3序列對比,證實其基因序列100%同源,提示Rev和DDX3真核表達載體構建成功。

  2.2Rev、DDX3基因分別在Huh7細胞中的表達重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag質粒分別轉染Huh7細胞,轉染24h后用熒光顯微鏡觀察熒光,可見Rev在熒光顯微鏡下發紅光,DDX3在熒光顯微鏡下發黃光;轉染48h后提取細胞總蛋白,通過Westernblot檢測Rev蛋白和DDX3的表達,凝膠成像儀成像結果證明重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag質粒能在Huh7細胞中表達相應的蛋白。

  2.3DDX3對細胞HCV復制的影響重組pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag和pCDNA3.1-JFH1質粒共轉染Huh-7細胞,48h后用TRIzol法提取細胞總RNA,qPCR檢測HCV的復制水平,進行對照組與實驗組的兩獨立樣本t檢驗。結果表明,瞬時轉染DDX3和HCV復制質粒后,HCV的復制水平(1.09×107±0.18×107)明顯高于HCV復制質粒單獨轉染后的HCV復制水平(4.79×106±1.24×106)(P=0.03)。提示,DDX3可以增強HCV在細胞中的復制。

  2.4Rev和DDX3共同作用對細胞HCV復制的影響重組pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag和pCDNA3.1-JFH1質粒共轉染入Huh-7細胞中,轉染48h后,提取細胞總RNA,進行qPCR檢測HCV的復制水平,進行對照組與實驗組的兩獨立樣本t檢驗。結果表明,Rev、DDX3和HCV復制質粒共轉染Huh-7細胞后,HCV的復制水平(1.74×107±0.40×107)明顯低于HCV單獨轉染后的HCV復制水平(4.17×107±0.46×107)(P<0.001)。Rev蛋白和DDX3共同作用可以抑制HCV的復制。

  3討論

  有研究證實循環血液中的HIVgp120蛋白在與肝細胞表面CCR5和CXCR4接觸后可激活肝細胞內TGFβ-1表達從而促進肝細胞內HCV的復制。有研究發現可以從CD4-CXCR4+的原代肝細胞中成功分離出HIV;并且Fromentin證實CD4-CXCR4-的某些肝癌細胞株也可以感染HIV。證明HIV和HCV可共感染同一肝細胞,表明二者有產生直接作用的可能。在HIV、HCV共感染的患者中,HIV可以促進HCV的復制,而且加速肝纖維化的進程。HIV合并HCV感染患者與HIV單獨感染患者比較,肝臟相關疾病是非AIDS引起死亡的主要原因。最新的研究表明,HIV和HCV合并感染加速疾病的進程,特別是HIV感染增加HCV的復制、肝細胞凋亡、腸道微生物的移位、損傷HCV的特異性免疫應答。對HIV合并HCV的患者分別進行HIV的抗病毒治療和HCV的抗病毒治療,結果表明抗病毒治療有效的延緩了肝纖維化的進程并減少了HIV合并HCV感染的患者終末期肝病的并發癥。然而HIV合并HCV感染的患者接受常規的PEG-IFN聯合利巴韋林治療所產生的持續性病毒學應答要比單獨HCV患者有明顯的降低。

  有研究表明,在HIV-1致病過程中,Rev蛋白發揮著重要作用,其可以促進HIV-1病毒顆粒的產生,并可以抑制病毒所有調節蛋白的產生。因HIV和HCV在細胞復制中無法自身合成RNA解旋酶,其在細胞中的復制需要細胞內的RNA解旋酶參與。DDX3屬于DEAD解旋酶家族,DDX3參與多種細胞進程,包括mRNA的剪接和轉錄、翻譯的起始和RNA的轉運。有研究顯示,DDX3可以與HIV-1中的Tat蛋白作用,刺激病毒mRNA的翻譯,也可以和Rev蛋白作用參與REV-RRE介導的輸出作用。有研究表明DDX3與HCVCore蛋白結合促進HCV的復制。同時也有學者發現HIV-1Rev蛋白可與DDX3結合在核膜上形成復合體從而影響細胞質內DDX3的水平。也有研究發現Rev蛋白可以與HCV5’-UTR作用直接促進HCV的復制。但是尚未有研究證實Rev可以通過間接作用影響HCV的復制,也沒有研究證實Rev蛋白和DDX3共同作用對HCV的影響。

  本研究證實pCDNA3.1-Rev-Flag-mCherry、pCDNA3.1-DDX3-YFP-Flag可以在真核細胞中表達;轉染后48hqPCR檢測發現,DDX3單獨與HCV作用時,可以促進HCVRNA的復制;當Rev和DDX3共同作用于HCV時,可以有效抑制HCVRNA的復制。可能原因:①Rev和DDX3在細胞中結合形成復合物,降低了細胞內DDX3的水平,降低了DDX3對HCVRNA的復制作用,從而競爭性抑制了DDX3對HCV復制的影響;②也有可能通過抑制某些信號通路從而影響HCVRNA的復制,因為Rev和DDX3不僅在HCV的表達中起作用,而且參與細胞中的多種信號通路,Rev和DDX3形成復合物后也抑制了相應的信號通路,導致HCVRNA的表達量下降;③或者改變了Rev和DDX3在細胞中的分布,導致它們無法在指定的作用位點與HCV進行相互作用,從而導致HCVRNA表達量的下降。


本文來源http://www.nvnqwx.com/shiyongwen/1557660.htm
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