理工醫科類學術論文寫作有許多共同的研究方法。下面重點介紹觀察法、試驗法、實驗法、邏輯法和模擬法。
　　（一）觀察法
　　科學觀察是客觀地觀察、記錄和描述事物或現象的認識活動，是科研工作者根據研究課題，利用眼睛、耳朵等感覺器官或通過輔助儀器和其他科學手段，有目的、有計劃地對處于某種條件下的客觀事物及其變化狀態進行系統觀察的一種科學研究方法。觀察法是理工醫科研究的基礎，能為后續的深入探究提供線索。觀察法具有目的性、計劃性、系統性和重復性等特點。在理工醫科研究的許多領域，都需要通過直接或借助儀器觀測試驗結果，收集試驗數據。
　　（二）試驗法
　　試驗法是指科研工作者為了了解某種已知事物的性能或者結果而進行的試用性操作的研究方法。試驗與實驗是不同的研究方法。實驗一般是為了檢驗某種科學理論或假設是否成立而進行的某種技術性操作研究活動；而試驗是為了檢驗某種材料或技術的結果，或某種事物的性能而從事技術性操作研究活動，試驗是為了探索新理論、新發明的實際應用是否可行，得到教訓的可能性比較大。
　　（三）實驗法
　　實驗法是在人為控制下，去觀察事物的變化運動規律。現代科學技術研究中，新的技術成果都是先在實驗室中發明創造出來的，許多新的理論的驗證也是在實驗室里完成的。理工醫科研究的實驗法主要有比較實驗、定性實驗、定量實驗、結構分析實驗、析因實驗、模型實驗、模擬實驗等。
　　（1）比較實驗：為了研究兩種以上研究對象間的異同、優劣等，常用比較實驗的方法。在比較實驗中，可以只進行單因子比較，也可以進行多因子比較。通常把研究對象分為兩個或兩個以上類似的群組，其中一個作為“對照組”,不加干涉，讓其自然發展；另一個或幾個作為實驗組，通過一定的實驗步驟，判斷研究對象是否具有某種性質。