康熙幼年智勇雙全除鰲拜的故事一直是歷史文學作品里的熱門主題，雖說是一朝之君，但小小年紀如何清除頑黨，或許幕后的推手是不可缺失的重要角色。

　　玄燁繼位后，四輔臣“擔當國事，裁決庶務;入白太后，則別無可否，惟唯諾而已。”可見孝莊放手使用，四輔臣權力很大。加之缺乏監督、約束的機制，輔臣中個別人逐步走上結黨營私、擅權亂政之路。

　　由于歷史的原因及某些政見不同，輔臣中兩黃旗的索尼(正黃旗)、遏必隆、鰲拜(鑲黃旗)，與正白旗蘇克薩哈的關系日漸緊張。另一方面，隨著時間的推移，鰲拜居功自傲，權力欲逐步滋長，他聯合遏必隆，擴展鑲黃旗實力，擅殺朝中與自己存有積怨的滿臣，專橫跋扈的作風愈來愈顯著。

　　四輔臣于輔政期間做了不少有益的事，然而對處理滿漢關系，卻采取保守、倒退方針，在恢復祖制、首崇滿洲的旗號下，歧視漢官，使后者的積極性受到嚴重挫傷。當時，反清復明的戰火尚未完全平息，經濟凋敝，百廢待興。因滿臣還缺乏治理經驗，又不能與漢官密切合作，以致大大妨礙了國家機器的正常運轉，而一些投機分子逐步取得輔臣信任，為非作歹，更加重了問題的嚴重性。玄燁親政前夕，已是“學校廢弛而文教日衰”，“風俗僭越而禮制日廢”，地方、朝中弊端叢生。

　　玄燁年齡還小，對此自然難以應付，但政治經驗豐富的孝莊，卻不露聲色地密切注視事態發展，在繼續任用輔臣的同時，采取了一些防患于未然的措施。

　　康熙四年(1665年)九月初八日，稟照祖母慈諭，12歲的玄燁舉行大婚典禮，索尼的兒子內大臣噶布喇之女赫舍里氏正位中宮，遏必隆之女落選，成為皇妃。

　　在為孫兒擇立皇后時，孝莊舍去遏必隆之女，選中赫舍里氏，旨在防范鰲拜借鑲黃旗之女成為皇后之機，進一步擴大實力，同時也是針對主幼臣驕的情況，對清朝元老索尼及其家族予以榮寵的籠絡措施。

　　孝莊此舉還改變了皇太極和福臨時期，皇后莫不出自蒙古博爾濟吉特氏的慣例。這并不意味著忽視滿蒙貴族聯姻政策，而是從鞏固皇權、安定政局的現實需要出發，反映出這位杰出女性的戰略眼光與靈活策略。

　　玄燁大婚標志少年皇帝正在步入青年，其親理政事已為期不遠。換言之，孝莊是以此為孫兒早日親政制造輿論，打下基礎。

　　當鰲拜得知玄燁選后的結果時，因希冀落空，“心懷妒忌”，氣惱萬分，竟與遏必隆一起入宮“奏阻”。這恰恰證明孝莊此步棋的巧妙:既分化了四輔臣，使索尼同鰲拜之間出現芥蒂，又促使索尼更為效忠皇室，增加了皇室的力量。不過，從其后情況看，孝莊這時對鰲拜還未完全失去信任，仍希望他在輔臣任內能夠善始善終。

　　康熙五年(1666年)，發生圈換土地事件。鰲拜在索尼、遏必隆支持下，將清朝入關初期圈占土地時分配給鑲黃旗與正白旗的土地，強行互換，并再次圈占大量土地，致使廣大農民流離失所，加劇了滿漢民族矛盾。三輔臣還不顧玄燁的反對，矯詔將反對此舉的大學士管戶部事務蘇納海(正白旗)等三名大臣處死，造成一大冤案。這一事件說明，鰲拜并未領會孝莊的包容苦心，在擅權亂政路上愈走愈遠。因此，孝莊也相應采取了進一步措施。

　　康熙六年(1667年)七月初七日，玄燁“躬親大政”，輔臣“仍行佐理”。孝莊特為孫兒收權安排一過渡階段，以使他在實踐中逐步提高;同時也讓輔臣有個適應過程，將他們因交權而產生的失落感，減少到最低程度，從而保證此次權力交接穩妥進行。

　　可是，樹欲靜而風不止。康熙六年六月索尼去世后，鰲拜成為首席輔臣，遏必隆對他亦步亦趨，蘇克薩哈更加孤立。玄燁親政伊始，蘇克薩哈請求“往守先帝陵寢”，以期迫使鰲拜、遏必隆也辭去輔政。鰲拜為清除異已，獨掌輔政大權，竟羅織蘇克薩哈的“罪狀”，企圖將他置于死地。盡管玄燁堅決反對，但鰲拜等不肯罷休，一連七日強奏，竟將蘇克薩哈及子孫全部處死，并籍沒家產。